Нилов Дмитрий Константинович
ведущий научный сотрудник

Избранные статьи

1. Nilov Dmitry K., Gushchina Irina V., Shcherbakova Tatyana A., Baldin Simon M., Švedas Vytas K. (2025) Inhibitors of transketolase from Mycobacterium tuberculosis targeted towards both the diphosphate binding site and an adjacent hydrophobic subsite. Biochemistry (Moscow), >>


2. Нилов Д.К., Гущина И.В., Щербакова Т.А., Балдин С.М., Швядас В.К. (2025) Ингибиторы транскетолазы Mycobacterium tuberculosis, нацеленные на сайт связывания дифосфата и близлежащий гидрофобный участок. Биохимия, >>


3. Pushkarev S.V., Kirilin E.M., Švedas V.K., Nilov D.K. (2024) Mechanism of PARP1 elongation reaction revealed by molecular modeling. Biochemistry (Moscow), >>


4. Лобанова Ангелина Андреевна, Коровина Анна Николаевна, Кошкина Дарья Олеговна, Черникова Полина Андреевна, Феофанов Алексей Валерьевич, Студитский Василий Михайлович, Нилов Дмитрий Константинович, Малюченко Наталия Валериевна (2024) Гель-электрофорез как метод классификации ингибиторов поли(АДФ-рибоза)-полимераз 1 и 2. Вестник Московского университета. Серия 16: Биология, >>


5. Shram S.I., Shcherbakova T.A., Abramova T.V., Smirnovskaya M.S., Balandina A.I., Kulikov A.V., Švedas V.K., Silnikov V.N., Myasoedov N.F., Nilov D.K. (2024) A new approach for studying poly(ADP-ribose) rolymerase inhibitors using permeabilized adherent cells. Biochemistry (Moscow), >>


6. Pervushin N.V., Nilov D.K., Pushkarev S.V., Shipunova V.O., Badlaeva A.S., Yapryntseva M.A., Kopytova D.V., Zhivotovsky B., Kopeina G.S. (2024) BH3‑mimetics or DNA‑damaging agents in combination with RG7388 overcome p53 mutation‑induced resistance to MDM2 inhibition. Apoptosis, >>


7. Kirsanov K.I., Fetisov T.I., Antoshina E.E., Gor’kova T.G., Trukhanova L.S., Shram S.I., Nagaev I.Yu, Zolotarev Yu A., Abo Qoura L., Pokrovsky V.S., Yakubovskaya M.G., Švedas V.K., Nilov D.K. (2024) 7-Methylguanine inhibits colon cancer growth in vivo. Acta Naturae (англоязычная версия), >>


8. Кирсанов К.И., Фетисов Т.И., Антошина Е.Е., Горькова Т.Г., Труханова Л.С., Шрам С.И., Нагаев И.Ю., Золотарев Ю.А., Або Кура Л., Покровский В.С., Якубовская М.Г., Швядас В.К., Нилов Д.К. (2024) 7-Метилгуанин подавляет рост аденокарциномы толстой кишки in vivo. Acta Naturae (русскоязычная версия), >>


9. Lobanova A.A., Korovina A.N., Koshkina D.O., Chernikova P.A., Feofanov A.V., Studitsky V.M., Nilov D.K., Maluchenko N.V. (2024) Gel Electrophoresis As a Method for Classifying Inhibitors of Poly(ADP-ribose) Polymerases 1 and 2. Moscow University biological sciences bulletin, >>


10. Шрам С.И., Щербакова Т.А., Абрамова Т.В., Смирновская М.С., Баландина А.И., Куликов А.В., Швядас В.К., Сильников В.Н., Мясоедов Н.Ф., Нилов Д.К. (2024) Новый подход для исследования ингибиторов поли(ADP-рибоза)-полимеразы, основанный на использовании пермеабилизованных адгезированных клеток. Биохимия, >>


11. Gushchina I.V., Nilov D.K., Shcherbakova T.A., Baldin S.M., Svedas V.K. (2023) Search for inhibitors of Mycobacterium tuberculosis transketolase in a series of sulfo-substituted compounds. Acta Naturae (англоязычная версия), >>


12. Гущина И.В., Нилов Д.К., Щербакова Т.А., Балдин С.М., Швядас В.К. (2023) Поиск ингибиторов транскетолазы из Mycobacterium tuberculosis в ряду сульфозамещенных соединений. Acta Naturae (русскоязычная версия), >>


13. Shram S.I., Shcherbakova T.A., Abramova T.V., Baradieva E.C., Efremova A.S., Smirnovskaya M.S., Silnikov V.N., Svedas V.K., Nilov D.K. (2023) Natural guanine derivatives exert PARP-inhibitory and cytoprotective effects in a model of cardiomyocyte damage under oxidative stress. Biochemistry (Moscow), >>


14. Шрам С.И., Щербакова Т.А., Абрамова Т.В., Барадиева Э.Ц., Ефремова А.С., Смирновская М.С., Сильников В.Н., Швядас В.К., Нилов Д.К. (2023) Природные производные гуанина оказывают PARP-ингибиторное и цитопротекторное действие на модели повреждения кардиомиоцитов при окислительном стрессе. Биохимия, >>


15. Shcherbakova T.A., Baldin S.M., Shumkov M.S., Gushchina I.V., Nilov D.K., Švedas V.K. (2022) Isolation and biochemical characterization of recombinant transketolase from Mycobacterium tuberculosis. Acta Naturae (англоязычная версия), >>


16. Щербакова Т.А., Балдин С.М., Шумков М.С., Гущина И.В., Нилов Д.К., Швядас В.К. (2022) Выделение и биохимическая характеристика рекомбинантной транскетолазы Mycobacterium tuberculosis. Acta Naturae (русскоязычная версия), >>


17. Popinako A.V., Pometun A.A., Nilov D.K., Dibrova D.V., Khrustalev V.V., Khrustaleva T.A., Iurchenko T.S., Nikolaeva A.Yu, Švedas V.K., Boyko K.M., Tishkov V.I., Popov V.O. (2022) The role of Tyr102 residue in the functioning of bacterial NAD+-dependent formate dehydrogenase of Pseudomonas sp. 101. Biochemical and Biophysical Research Communications, >>


18. Nilov D.K., Schmidtke M., Makarov V.A., Švedas V.K. (2022) Search for ligands complementary to the 430-cavity of influenza virus neuraminidase by virtual screening. Supercomputing Frontiers and Innovations, >>


19. Nilov D.K., Zamaraev A.V., Zhivotovsky B., Kopeina G.S. (2022) Exploring Caspase Mutations and Post-Translational Modification by Molecular Modeling Approaches. Jove-Journal of Visualized Experiments, >>


20. Kurgina T.A., Shram S.I., Kutuzov M.M., Abramova T.V., Shcherbakova T.A., Maltseva E.A., Poroikov V.V., Lavrik O.I., Švedas V.K., Nilov D.K. (2022) Inhibitory effects of 7-methylguanine and Its metabolite 8-hydroxy-7-methylguanine on human poly(ADP-ribose) polymerase 1. Biochemistry (Moscow), >>


21. Kirsanov K., Fetisov T., Antoshina E., Trukhanova L., Gor’kova T., Vlasova O., Khitrovo I., Lesovaya E., Kulbachevskaya N., Shcherbakova T., Belitsky G., Yakubovskaya M., Švedas V., Nilov D. (2022) Toxicological properties of 7-methylguanine, and preliminary data on its anticancer activity. Frontiers in pharmacology, >>


22. Кургина Т.А., Шрам С.И., Кутузов М.М., Абрамова Т.В., Щербакова Т.А., Мальцева Е.А., Поройков В.В., Лаврик О.И., Швядас В.К., Нилов Д.К. (2022) Ингибиторное действие 7-метилгуанина и его метаболита 8-гидрокси-7-метилгуанина на поли(ADP-рибозо)полимеразу 1 человека. Биохимия, >>


23. Пушкарев С.В., Винник В.A., Шаповалова И.В., Швядас В.К., Нилов Д.К. (2022) Моделирование структуры комплекса тРНК-гуанинтрансгликозилазы человека с 7-метилгуанином и выявление факторов, определяющих взаимодействие фермента с ингибиторами. Биохимия, >>


24. Pushkarev Sergey V., Vinnik Valeriia A., Shapovalova Irina V., Švedas Vytas K., Nilov Dmitry K. (2022) Modeling the Structure of Human tRNA-Guanine Transglycosylase in Complex with 7-Methylguanine and Revealing the Factors that Determine the Enzyme Interaction with Inhibitors. Biochemistry (Moscow), >>


25. Manasaryan G., Suplatov D., Pushkarev S., Drobot V., Kuimov A., Švedas V., Nilov D. (2021) Bioinformatic analysis of the nicotinamide binding site in poly(ADP-ribose) polymerase family proteins. Cancers, >>


26. Evteev S., Nilov D., Polenova A., Švedas V. (2021) Bifunctional inhibitors of influenza virus neuraminidase: molecular design of a sulfonamide linker. International Journal of Molecular Sciences, >>


27. Maluchenko Natalya V., Nilov Dmitry K., Pushkarev Sergey V., Kotova Elena Y., Gerasimova Nadezhda S., Kirpichnikov Mikhail P., Langelier Marie-France, Pascal John M., Akhtar Md Sohail, Feofanov Alexey V., Studitsky Vasily M. (2021) Mechanisms of Nucleosome Reorganization by PARP1. International Journal of Molecular Sciences, >>


28. Kovaleva K., Yarovaya O., Ponomarev K., Cheresiz S., Azimirad A., Chernyshova I., Zakharenko A., Konev V., Khlebnikova T., Mozhaytsev E., Suslov E., Nilov D., Švedas V., Pokrovsky A., Lavrik O., Salakhutdinov N. (2021) Design, synthesis, and molecular docking study of new tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 (TDP1) inhibitors combining resin acids and adamantane moieties. Pharmaceuticals, >>