Departments Department of Virus-Cell Interactions

Department of Virus-Cell Interactions

Leader: Sergey E. Dmitriev


Отдел организован в 1965 г. чл.-корр. РАН и РАМН, заслуженным деятелем науки РФ, профессором В.И.Аголом, который и руководит им до настоящего времени.
Основные направления исследований
Изучение молекулярных механизмов репродукции РНК-содержащих вирусов. Исследование природы патогенного действия вирусов на клетку. Выяснение закономерностей и механизмов эволюции РНК-содержащих вирусов. Изучение молекулярной эпидемиологии полиовирусов и других энтеровирусов.
Научные достижения отдела
(i) Синтез вирусных белков и его регуляция
(ii) Рекомбинация РНК-геномов
(iii) Синтез пикорнавирусных РНК
(iv) Реакция клетки на вирусную инфекцию
(v) Молекулярная эпидемиология
Участие в научно-исследовательских проектах и грантовая поддержка
Выполнялись и выполняются совместные проекты в России: с Институтом полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П.Чумакова РАМН, Институтом белка РАН и за рубежом: Food and Drug Administration (USA); National Institutes of Health (USA), Univ. of Wisconsin (USA), Univ. of Basel (Switzerland), Univ. of Nijmegen (the Netherlands) и др.
Гранты (в разные годы): ряд грантов РФФИ, Роснауки, Федеральной программы «Ведущие научные школы», грант президента РФ для поддержки молодых российских ученых (кандидатов наук) (М.Л.Яковенко), программа "Интеграция", Международного научного фонда, Copernicus, EU, Human Frontier Science Program, CRDF, INTAS, World Health Organization, Fogarty, National Multiple Sclerosis Society (USA), Ludwig Institute for Cancer Research и др..
Научные премии
  • В.И.Агол получил премию «Триумф», избран иностранным членом Болгарской академии наук;
  • М.Л.Яковенко получила стипендию Л'Ореаль-ЮНЕСКО для молодых российских женщин-ученых и стипендию МГУ для талантливых молодых преподавателей и ученых.
  • Г.Ю. Липская получила премию Минвуза РФ.
Преподавательская деятельность
Отдел участвует в преподавательской делятельности на ФББ и Биофаке МГУ. В. И. Агол много лет читал спецкурс «Репликация и транскрипция вирусных геномов» для студентов 5 курса кафедры вирусологии Биофака. Последние годы, 2011 включительно, В.И. Агол читал лекции «Происхождение и эволюция вирусов» студентам кафедры вирусологии Биофака. М.Л. Яковенко и А.Ю. Красота ведут Практикум по генной инженерии на ФББ. В отделе на данный момент работают 2 студента и 3 аспиранта по следующим темам:
Аспиранты:
  • Ивин Ю.Ю. (ФББ) "Роль вирусных и клеточных белков в патологии клетки при пикорнавирусной инфекции."
  • Гаспарян А.А. (Биофак) "Самоповреждающие клеточные механизмы при пикорнавирусной инфекции."
  • Шишова А. (Биофак) "Поиск возможных молекулярных механизмов нерепликативной РНК-рекомбинации полиовируса."
Студенты:
  • Шерстюк А. (Биофак) "Влияние антигенной изменчивости полиовирусов на эффективность их взаимодействия с клеточным рецептором."
  • Минтаев Р. (Биофак) "Детекция, идентификация и молекулярно-эпидемиологическое исследование энтеровирусов, выделенных от больных с диагнозом серозный менингит."
Подразделения отдела Основное направление исследований - молекулярная эпидемиология полиомиелита и энтеровирусных инфекций. Расшифровка спорадической заболеваемости и вспышек, включая детекцию типирование и внутритиповую дифференциацию штаммов и их филогенетический анализ.  


 

Articles

  • Kamynina Margarita, Rozenberg Julian M., Kushchenko Artem S., Dmitriev Sergey E., Modestov Aleksander, Kamashev Dmitry, Gaifullin Nurshat, Shaban Nina, Suntsova Maria, Emelianova Anna, Buzdin Anton A.(2024) Forced Overexpression and Knockout Analysis of SLC30A and SLC39A Family Genes Suggests Their Involvement in Establishing Resistance to Cisplatin in Human Cancer Cells. International Journal of Molecular Sciences, >>
  • Тихонов С.А., Батин М.А., Гладышев В.Н., Дмитриев С.Е., Тышковский А.Э.(2024) AgeMeta: количественная база данных изменений экспрессии генов в процессе старения млекопитающих. Биохимия, >>
  • Tikhonov Stanislav, Batin Mikhail, Gladyshev Vadim N., Dmitriev Sergey E., Tyshkovskiy Alexander(2024) AgeMeta: Quantitative Gene Expression Database of Mammalian Aging. Biochemistry (Moscow), >>
  • Makeeva Desislava S., Riggs Claire L., Burakov Anton V., Ivanov Pavel A., Kushchenko Artem S., Bykov Dmitri A., Popenko Vladimir I., Prassolov Vladimir S., Ivanov Pavel V., Dmitriev Sergey E.(2023) Relocalization of Translation Termination and Ribosome Recycling Factors to Stress Granules Coincides with Elevated Stop-Codon Readthrough and Reinitiation Rates upon Oxidative Stress. Cells, >>
  • Bennett Dominic F., Goyala Anita, Statzer Cyril, Beckett Charles W., Tyshkovskiy Alexander, Gladyshev Vadim N., Ewald Collin Y., de Magalhães João Pedro(2023) Rilmenidine extends lifespan and healthspan in Caenorhabditis elegans via a nischarin I1-imidazoline receptor. Aging Cell, >>
  • Zhang Bohan, Lee David E., Trapp Alexandre, Tyshkovskiy Alexander, Lu Ake T., Bareja Akshay, Kerepesi Csaba, McKay Lauren K., Shindyapina Anastasia V., Dmitriev Sergey E., Baht Gurpreet S., Horvath Steve, Gladyshev Vadim N., White James P.(2023) Multi-omic rejuvenation and life span extension on exposure to youthful circulation. Nature Aging, >>
  • Tyshkovskiy Alexander, Ma Siming, Shindyapina Anastasia V., Tikhonov Stanislav, Lee Sang-Goo, Bozaykut Perinur, Castro José P., Seluanov Andrei, Schork Nicholas J., Gorbunova Vera, Dmitriev Sergey E., Miller Richard A., Gladyshev Vadim N.(2023) Distinct longevity mechanisms across and within species and their association with aging. Cell, >>
  • Fernando Raquel, Shindyapina Anastasia V., Ost Mario, Santesmasses Didac, Hu Yan, Tyshkovskiy Alexander, Yim Sun Hee, Weiss Jürgen, Gladyshev Vadim N., Grune Tilman, Castro José Pedro(2023) Downregulation of mitochondrial metabolism is a driver for fast skeletal muscle loss during mouse aging. Communications Biology, >>
  • Aguado Julio, Amarilla Alberto A., Taherian Fard Atefeh, Albornoz Eduardo A., Tyshkovskiy Alexander, Schwabenland Marius, Chaggar Harman K., Modhiran Naphak, Gómez-Inclán Cecilia, Javed Ibrahim, Baradar Alireza A., Liang Benjamin, Peng Lianli, Dharmaratne(2023) Senolytic therapy alleviates physiological human brain aging and COVID-19 neuropathology. Nature Aging, >>
  • Zhang Zhihui, Tian Xiao, Lu J.Yuyang, Boit Kathryn, Ablaeva Julia, Zakusilo Frances Tolibzoda, Emmrich Stephan, Firsanov Denis, Rydkina Elena, Biashad Seyed Ali, Lu Quan, Tyshkovskiy Alexander, Gladyshev Vadim N., Horvath Steve, Seluanov Andrei, Gorbunova(2023) Increased hyaluronan by naked mole-rat Has2 improves healthspan in mice. Nature, >>
  • Yang Jae-Hyun, Petty Christopher A., Dixon-McDougall Thomas, Lopez Maria Vina, Tyshkovskiy Alexander, Maybury-Lewis Sun, Tian Xiao, Ibrahim Nabilah, Chen Zhili, Griffin Patrick T., Arnold Matthew, Li Jien, Martinez Oswaldo A., Behn Alexander, Rogers-Hammo(2023) Chemically induced reprogramming to reverse cellular aging. AGING-US, >>
  • Ribeiro Rui, Macedo Joana C., Costa Madalena, Ustiyan Vladimir, Shindyapina Anastasia V., Tyshkovskiy Alexander, Gomes Rita N., Castro José Pedro, Kalin Tanya V., Vasques-Nóvoa Francisco, Nascimento Diana S., Dmitriev Sergey E., Gladyshev Vadim N., Kalini(2022) In vivo cyclic induction of the FOXM1 transcription factor delays natural and progeroid aging phenotypes and extends healthspan. Nature Aging, >>
  • Shindyapina Anastasia V., Cho Yongmin, Kaya Alaattin, Tyshkovskiy Alexander, Castro José P., Deik Amy, Gordevicius Juozas, Poganik Jesse R., Clish Clary B., Horvath Steve, Peshkin Leonid, Gladyshev Vadim N.(2022) Rapamycin treatment during development extends life span and health span of male mice and Daphnia magna. Science Advances, >>
  • Emmrich Stephan, Trapp Alexandre, Zakusilo Frances Tolibzoda, Straight Maggie E., Ying Albert K., Tyshkovskiy Alexander, Mariotti Marco, Gray Spencer, Zhang Zhihui, Drage Michael G., Takasugi Masaki, Klusmann Jan-Henning, Gladyshev Vadim N., Seluanov Andr(2022) Characterization of naked mole-rat hematopoiesis reveals unique stem and progenitor cell patterns and neotenic traits. EMBO Journal, >>
  • Oz Naci, Vayndorf Elena M., Tsuchiya Mitsuhiro, McLean Samantha, Turcios-Hernandez Lesly, Pitt Jason N., Blue Benjamin W., Muir Michael, Kiflezghi Michael G., Tyshkovskiy Alexander, Mendenhall Alexander, Kaeberlein Matt, Kaya Alaattin(2022) Evidence that conserved essential genes are enriched for pro-longevity factors. GEROSCIENCE, >>
  • Egorov Artyom A., Alexandrov Alexander I., Urakov Valery N., Makeeva Desislava S., Edakin Roman O., Kushchenko Artem S., Gladyshev Vadim N., Kulakovskiy Ivan V., Dmitriev Sergey E.(2021) A standard knockout procedure alters expression of adjacent loci at the translational level. Nucleic Acids Research, >>
  • Egorova Tatiana, Biziaev Nikita, Shuvalov Alexey, Sokolova Elizaveta, Mukba Sabina, Evmenov Konstantin, Zotova Maria, Kushchenko Artem, Shuvalova Ekaterina, Alkalaeva Elena(2021) eIF3j facilitates loading of release factors into the ribosome. Nucleic Acids Research, >>
  • Markby Jessica, Sonjelle Shilton, Xiaohui Sem, Keat Chan Huan, Md Said Rosaida, Sasikala Siva, Zalwani Zainuddin, Abu Bakar Norasiah, Haniza Omar, Jose III Ruiz Ryan, Mary Gaeddert, Alexander Tyshkovskiy, Madeline Adee, Jagpreet Chhatwal, Suresh Kumar, Je(2021) Assessing the impact of simplified HCV care on linkage to care amongst high-risk patients at primary healthcare clinics in Malaysia: a prospective observational study. BMJ open, >>
  • Markby Jessica, Gupta Ekta, Soni Divya, Sarin Sanjay, Murya Mugil, Katapur Preetishirin, Tewatia Navneet, Ramachandran Babu Entoor, Ruiz Ryan Jose, Gaeddert Mary, Tyshkovskiy Alexander, Adee Madeline, Chhatwal Jagpreet, Miglani Sundeep, Easterbrook Philip(2021) Feasibility, effectiveness and cost of a decentralized HCV care model among the general population in Delhi, India. Liver International, >>
  • Kaya Alaattin, Phua Cheryl Zi Jin, Lee Mitchell, Wang Lu, Tyshkovskiy Alexander, Ma Siming, Barre Benjamin, Liu Weiqiang, Harrison Benjamin R., Zhao Xiaqing, Zhou Xuming, Wasko Brian M., Bammler Theo K., Promislow Daniel EL, Kaeberlein Matt, Gladyshev Vad(2021) Evolution of natural lifespan variation and molecular strategies of extended lifespan. eLife, >>
  • Tyshkovskiy Alexander, Panchin Alexander Y.(2021) There is still no evidence of SARS-CoV-2 laboratory origin: Response to Segreto and Deigin (10.1002/bies.202100137). BioEssays, >>
  • Tyshkovskiy Alexander, Panchin Alexander Y.(2021) There is no evidence of SARS‐CoV‐2 laboratory origin: Response to Segreto and Deigin (https://doi.org/10.1002/bies.202000240). BioEssays, >>
  • Vetter Beatrice N., Reipold Elena Ivanova, Ongarello Stefano, Fajardo Emmanuel, Tyshkovskiy Alexander, Ben Iryna, Vasylyev Marta(2021) Prospective evaluation of hepatitis C virus antibody detection in whole blood collected on dried blood spots with the INNOTEST® HCV Ab IV enzyme immunoassay. Journal of Clinical Virology, >>